作为“大秦帝国”系列剧集的收官之作，该剧延续了前三部作品的史诗正剧风格定位，呈现了秦始皇嬴政从出生到建立大一统国家共40余年的历史风云。

淳于越也不满芈启的敷衍之意，认为芈启不愿帮助吕氏。芈颠气走赢傒赢杰，赢杰不满秦王政重用外客，建议赢傒谏言处置吕不韦。淳于越想到了救吕氏一门的对策，就是想办法迎归太后赵姬。一些大臣前往章台劝说赢政迎归太后，赢政大怒，斩了二十七位大臣。

赢政让蒙毅抱着扶苏去给吕不韦送行，并交给他一块玄鸟玉佩。吕不韦离开咸阳，赢政收到吕不韦的留书，并觉得吕不韦的建议甚好，遂要求郑国渠加快工期，为灭国大战做好准备。宗室众人驱逐外客之心不死，想要通过清查修渠账册抓住外客把柄，无意间听到韩秘使来找郑国，让郑国拖延修渠工期一事。郑国被抓，但没有立即行刑，宗室众人心有不甘，在章台宫前纵火自焚，逼迫蠃政。嬴政苦劝嬴傒无果，遂颁布逐客令，宗室众人喜不自胜。逐客令下，外客纷纷离秦，宗室接掌大秦政务。

为补救过失，赢傒、赢杰连夜赶往修渠工地，路上遇见要离秦的李斯，李斯 将自己所作的《谏逐客书》交给赢傒，请他代呈给赢政。方面，宗室处理政务虽有模有样，却暗藏巨大纰漏，秦王秘密带郑国前往修渠工地，探查渠务。另一方面，蒙恬在函谷关阻拦外客离秦，并向李斯传达王命，笼络住离秦的外客是当务之急。与此同时，山东六国听闻秦国逐客，纷纷趁机延揽离秦的人才，赵国更是在邯郸设立金台，效仿当年的燕人千金买骨。

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